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전사체
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전사체는 세포내에서 발현하고 있는 모든 RNA의 총합입니다.
RNA-Seq을 통해 새로운 유전자 발굴 및 유전자 발현 양상을 확인할 수 있습니다.
De novo Assembly를 통한 신규 유전자 세트 구성, 알려진 유전자/유전체 정보를 이용한 DEG, Non-coding RNA, Single-cell RNA 등 다양한 분석이 가능합니다.
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DEG(Differential
Expressed gene) -
NGS 데이터를 이용하여 유전자 발현양상을 예측하고, 샘플간 통계적으로 유의하게 발현패턴이 다른 유전자를 발굴합니다.
유전자의 기능 분석을 통해 다양한 생물학적 경로(Biological Pathway)와 복합적인 현상을 이해할 수 있도록 지원합니다.
DEG 유전자 발굴
유전자 Heatmap 및 기능분석
형질과 발현값의 상관관계 분석
DEG - Pathway 연관 분석
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Non-coding
RNA -
Non-coding RNA는 단백질로 Translation되지 않는 RNA로 Long Non-coding RNA와 Small RNA로 구분이 됩니다.
전사체 데이터로 부터 여러 단계의 선발 과정을 통해 Non-coding RNA를 탐색하고 발현양상의 비교 분석 결과를 제공합니다.
Hairpin 구조의 miRNA Precursor 탐색
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Single-cell RNA
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일반적인 RNA-Seq은 조직 전체의 모든 세포의 발현 평균값을 이용하는 Bulk RNA-Seq인 반면,
Single-cell RNA 분석은 각각의 세포 별로 발현량을 확인하고, 몇 종류의 세포 타입이 존재한지 분석하여 보다 심도있는 생물학적 의미를 도출합니다.